Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms