Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms