Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms