Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms