Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR8

Tmem9b, Transmembrane protein 9B, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem9bQ9JJR8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tmem9bQ9JJR8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tmem9bQ9JJR8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tmem9bQ9JJR8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Tmem9bQ9JJR8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Tmem9bQ9JJR8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Tmem9bQ9JJR8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Tmem9bQ9JJR8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem9bQ9JJR8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tmem9bQ9JJR8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tmem9bQ9JJR8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem9bQ9JJR8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms