Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms