Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms