Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc22Q9JIG7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms