Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms