Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn10Q9ESK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms