Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scn4aQ9ER60 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms