Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock2Q9ER58 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock2Q9ER58 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms