Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms