Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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