Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms