Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms