Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms