Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms