Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN5

Lonp2, Lon protease homolog 2, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonp2Q9DBN5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lonp2Q9DBN5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonp2Q9DBN5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms