Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cmtr1Q9DBC3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms