Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms