Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TrmuQ9DAT5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms