Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms