Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim23Q9DAL0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms