Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms