Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms