Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e2Q9D902 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms