Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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