Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Chp2Q9D869 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chp2Q9D869 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Chp2Q9D869 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Chp2Q9D869 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Chp2Q9D869 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp2Q9D869 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms