Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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