Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms