Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms