Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms