Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr42e1Q9D665 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms