Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms