Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrameQ9D4Z5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms