Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ribc2Q9D4Q1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ribc2Q9D4Q1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ribc2Q9D4Q1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ribc2Q9D4Q1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ribc2Q9D4Q1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ribc2Q9D4Q1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms