Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms