Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D2Q3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D2Q3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms