Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms