Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trappc6bQ9D289 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trappc6bQ9D289 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trappc6bQ9D289 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trappc6bQ9D289 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trappc6bQ9D289 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trappc6bQ9D289 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trappc6bQ9D289 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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