Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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