Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift27Q9D0P8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift27Q9D0P8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms