Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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