Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elp3Q9CZX0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elp3Q9CZX0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elp3Q9CZX0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elp3Q9CZX0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elp3Q9CZX0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Elp3Q9CZX0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms