Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU6

Cs, Citrate synthase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsQ9CZU6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CsQ9CZU6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CsQ9CZU6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms