Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms