Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc77Q9CZH8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms