Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms