Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms